エンブレムはVer2.5から実装された機能である。
大方の場合ブラスト前面左肩・背面右肩に表示（ツェーブラ、ケーファー、ディスカス、B.U.Z.など例外パーツもあり）。メインとベースを組み合わせる他、組み合わせが固定となるスペシャルも使用できる。
スペシャルを使用するには、事前にBB.NETで組み合わせを登録したセットを用意しておく必要がある。
また、セットにはメインとベース、さらにそれぞれのカラーを組み合わせたものを登録しておくこともできる。
エンブレムに使用できるカラーは以下の16つ。

エンブレムの変更は機体ペイントの変更と共通で1回100GPが必要となる。
実際にどんな形状なのかはこちら。

クエスト報酬でエンブレムを得た場合、使用するには報酬受け取り操作に加え カード割り当て操作が必要 である点に注意。
「カードトップ」→「▼アーケード連動」→「[７]BB.NET連動アイテム」から、登録している好きなカードに割り当てられる。

クエスト報酬以外のエンブレム獲得条件は今現在不明。

エンブレムの種類と入手条件をこのページにまとめる。